Zwitterione e comportamento anfotero
Gli amminoacidi contengono un gruppo carbossilico acido e un gruppo amminico basico. In soluzione acquosa possono formare uno ione dipolare, o zwitterione: il gruppo e il gruppo coesistono, con carica netta zero. Per questo sono anfoteri: in ambiente acido acquistano un protone e diventano cationi; in ambiente basico cedono un protone e diventano anioni.
Punto isoelettrico
Il punto isoelettrico () è il in cui la specie prevalente ha carica netta nulla. Per un amminoacido senza catene laterali cariche si usa dove riguarda il carbossile e il gruppo amminico. Con catene laterali ionizzabili si individuano le specie in ordine di e si mediano i due valori che racchiudono lo zwitterione. Al la solubilità è minima.
Elettroforesi
L'elettroforesi separa gli amminoacidi sfruttando la carica in un campo elettrico.
- Se il del tampone è inferiore al , prevale la forma cationica e la migrazione è verso il catodo.
- Se il è superiore al , prevale l'anione e la migrazione è verso l'anodo.
- Al la carica netta è zero e non c'è migrazione; una differenza maggiore tra e aumenta carica netta e velocità.